В 1976 году закончил Уральский политехнический институт. Был организатором и первым президентом КСП «Зелёная лампа».
Стихи пишет с 1975 года. С 1977 года на стихи М. Сипера написано около сотни песен его земляком Василием Мешавкиным. Песни на стихи М. Сипера публиковались в книгах «Наполним музыкой сердца» (Москва, 1989), «Люди идут по свету» (Москва, 1989), «Грушинский» (Куйбышев, 1990), «Смех сквозь струны» (Москва, 1995), «Антология авторской песни» (У-Фактория, 2002), «Антология бардовской песни» («Эксмо», Москва, 2005), в различных фестивальных сборниках и буклетах, использовались в спектаклях «Пифагор» и «С днем рождения, Ванда Джун!». Стихи публиковались в антологии «Alter ego», альманахе «Альбион», журнале «Дон», газете «День литературы», неоднократно печатались в периодике разных стран. Автор сборников стихов «Из неперечёркнутого» (1996), «Инверсионный след» (2010), «Песок под микроскопом» (2015), «Снятие боли» (2016), сборников стихов и прозы «Струна, порезанная пальцем» (2005), «Время собирать камни» (2019).
Финалист и призер «Пушкин в Британии» (2004–2007, 2011–2012). В апреле 2008 года Михаилу Сиперу присуждена Золотая медаль Франца Кафки.
С 1991 живёт в Израиле.